फिर से मेट्रिक्स की सिम्युलेटेड रिएलिटी में आ फंसे निओ को लगता है कि वह वीडियो गेम क्रिएटर थॉमस एंडरसन है. यह गलतफ़हमी तब दूर हो जाती है जब उसे बच निकलने का एक और मौका दिया जाता है.